与IgA肾病预后有关的因素是：（1）男性患者，起病年龄较大者预后差。（2）有人认为单纯或反复血尿患者多为良性过程。多数学者认为持续性镜下血尿伴有蛋白尿者预后差。（3）大量蛋白尿或肾病综合征对预后的影响看法不一。多数学者认为，中、重度蛋白尿常提示最终将发展为肾功能不全，预后较差。但我国资料说明，IgA肾病表现为肾病综合征的患者，若肾脏组织病理变化轻微，对糖皮质激素治疗反应好，则预后较好。（4）有高血压、特别是难于控制的严重高血压的IgA肾病患者预后差，可能造成肾功能迅速减退。但多数患者肾功能减退的快慢不一致。（5）病理改变对预后影响大。严重的增生、肾小球硬化、新月体形成、毛细血管壁损害、间质纤维化和血管损害为IgA肾病预后不良的指征。IgA沉积的部位与预后亦有关，肾小球毛细血管壁有IgA沉积者，较单纯系膜区IgA沉积者病理改变重，预后差。伴有纤维连接蛋白（FN）沉积者预后不良。