肾结石的症状取决于结石的大小，形状、所在部位和有无感染、梗阻等并发症。
(1)肾绞痛：出现肾绞痛常表现上尿路有结石，多在夜间或清晨突然发作。结石阻塞尿路或处于下移状态时，肾绞痛加剧。患者痛苦异常，疼痛可向同侧腹股沟和睾丸或大阴唇放射；当结石在输尿管某一段且局部发生炎症时，绞痛以这一局部为著；结石移近膀胱时，肾绞痛可再次发生，并出现尿频、尿急及尿痛等症状。肾脏和胃肠的神经支配同属腹腔神经丛，故肾绞痛常可伴恶心、呕吐及肠麻痹症状，容易与急性胃肠炎、急性阑尾炎、结肠炎或输卵管炎相混淆。
(2)血尿、脓尿：急性肾绞痛常伴明显肉眼或镜下血尿。结石停止移动数天后，血尿消失。少数结石引起完全性阻塞时可无血尿。结石若合并感染，则血尿和脓尿同时发生。个别由于肾结石长期刺激，导致肾内上皮化生，芦至发生磷状上皮癌，这时将呈持续性严重血尿。
(3)急性梗阻性少尿、无尿：独肾(对侧肾缺如或无功能)患者或双侧输尿管结石，可引起急性梗阻性少尿或无尿。临床表现，般为急性梗阻侧肾区疼痛、少尿或无尿、尿毒症、心力衰竭、高血压；高血钾及严重酸中毒。
(4)、慢性肾功能衰竭：独肾或双侧肾结石患者，若结石长期阻塞或合并感染，可造成慢性肾功能衰竭。患者肾区疼痛不明显，甚至无自觉性疼痛，主要表现为泌尿系感染、胃肠症状，贫血、心力衰竭、腹部包块或原因不明的发热，极易造成误诊。